Varsinais-Suomen hyvinvointialueen Tyks Laboratorioiden palvelualueella on tarve hankkia suuren kapasiteetin NGS/rinnakkaissekvensointilaite sekä laitteen huolto.

NGS/rinnakkaissekvensointilaitetta käytetään perinnöllisten ja somaattisten DNA- ja RNA -näytteiden diagnostisessa testauksessa kattaen koko eksomin- ja koko genomin laajuiset tutkimukset. Hankittavalla laitteella tulee pystyä ajamaan kirjastoja lyhyen readin (short read) -teknologialla sekä etäisyyskartoitukseen perustuvalla teknologialla (tuottaa informaatiota pidemmiltä genomin alueilta). Laitteella ajettavien kirjastojen valmistuksessa tulee voida käyttää laboratoriossa tällä hetkellä käytössä olevilla DNA-eristysmenetelmillä eristettyjä näytteitä. NGS/rinnakkaissekvensointilaiteen tulee toimia varalaitteena jo laboratoriossa oleville sekvensaattoreille ilman laajamittaista validointia. Laitteen tulee olla kapasiteetiltaan joustava siten, että rutiinidiagnostiikassa voidaan tarpeen mukaan sekvensoida sekä pienempiä näytesarjoja (korkeintaan 12 näytettä) sekä suuria koko genomin näytesarjoja (vähintään 48 näytettä).

Julkisista hankinnoista ja käyttöoikeussopimuksista annetun lain (1397/2016) 40 §:n 2 momentin 2 kohdan mukaan hankintayksikkö voi valita suorahankinnan, jos teknisestä tai yksinoikeuden suojaamiseen liittyvästä syystä vain tietty toimittaja voi toteuttaa hankinnan; lisäedellytyksenä on, että järkeviä vaihtoehtoisia tai korvaavia ratkaisuja ei ole eikä kilpailun puuttuminen johdu hankinnan ehtojen keinotekoisesta kaventamisesta.

Hankintayksikön tekemän selvityksen mukaan markkinoilla ei ole muita vaatimuksien täyttävää suuren kapasiteetin NGS/rinnakkaissekvensointilaitetta kuin Illumina Finland Oy:n NovaSeq X –laite.